A 1ª edição da Copa do Brasil Sub-17 será realizada de 16 de julho a 31 de agosto.
A competição terá 32 clubes em cinco Fases eliminatórias, com partidas de ida e volta. Os clubes participantes são os 20 que estiveram no Campeonato Brasileiro da Série A/2012 e os 12 primeiros colocados da Série B/2012.
Os jogos da 1ª Fase serão nos dias 16, 17, 20 e 21 de julho. Nesta etapa, caso o time visitante vença por diferença mínima de 2 gols, não será realizada a partida de volta.
Nas duas primeiras Fases, a ordem de mando de campo é definida pelo ranking de clubes da CBF. A partir da terceira etapa a definição será através de sorteio.
A competição será realizada nos mesmos moldes da Copa do Brasil de profissionais, e as despesas são todas custeadas pela CBF.
Após o campeão Sub-17 ser conhecido, será iniciada a disputa da Copa do Brasil Sub-20, em sua segunda edição, que começará no dia 3 de setembro.
Os dois representantes goianos, Atlético e Goiás, na 1ª Fase da Copa do Brasil Sub-17 estão respectivamente nos Grupos 8 e 6.
O adversário do Atlético é o Bahia, com o jogo de ida no Estádio Zico Brandão em Inhumas, onde o Atlético mandará os seus jogos na competição, na terça-feira, dia 16/07/13, às 15:00 horas. A partida de volta, caso seja necessário, será no sábado, dia 20/07/13, às 16:00 horas, no Estádio Roberto Santos em Salvador.
O adversário inicial do Goiás é o Santos, a exemplo da Copa do Brasil Sub-20 do ano passado, com a partida de ida no Estádio Hailé Pinheiro em Goiânia, na quarta-feira, dia 17/07/13, às 20:30 horas. O jogo de volta, caso seja necessário, será no sábado, dia 20/07/13, às 21:45 horas, no Estádio da Vila Belmiro em Santos com transmissão pela Sportv 2.
O classificado de Bahia x Atlético terá como adversário na 2ª Fase, o classificado do confronto entre Botafogo x Ponte Preta, enquanto o classificado de Santos x Goiás, na 2ª Fase terá como adversário o classificado do confronto entre Atlético (MG) x Náutico.
Os dois representantes goianos poderão se enfrentar nas Quartas-de-Final, se vierem eliminar os seus respectivos adversários nas duas primeiras Fases da competição.