O Atlético estreou na Copa do Brasil Sub-20/2013 perdendo por 2x0 para o Cruzeiro (MG) no Estádio Zico Brandão em Inhumas na partida de ida entre os dois times pelo Grupo 2 da 1ª Fase da competição.
Com o resultado, o Atlético está eliminado da Copa do Brasil Sub-20, sem a necessidade da realização da partida de volta.
O Cruzeiro (MG) nas Oitavas-de-Final terá como adversário o Criciúma (SC) que eliminou o Corinthians (SP) na 1ª Fase.
